เมื่อวันที่ 6 เมษายน นายอภิสิทธิ์ เวชชาชีวะ นายกรัฐมนตรี ปฎิเสธหยิบยกประเด็นปัญหาความขัดแย้งขึ้นหารือกับผู้นำกัมพูชา ระหว่างการประชุมสุดยอดอาเซียนบวก 3 และ บวก 6 ที่พัทยา จ.ชลบุรีปลายสัปดาห์นี้ ภายหลังทหารไทยและกัมพูชาปะทะกันหลายระลอกบริเวณพื้นที่พิพาทแนวชายแดนใกล้เคียงประสาทพระวิหาร ต.เสาธงชัย อ.กันทรลักษ์ จ.ศรีสะเกษ จนเป็นเหตุให้ทหารไทยเสียชีวิตและบาดเจ็บจำนวนหนึ่ง
นายอภิสิทธิ์กล่าวว่า สำหรับสถานการณ์ชายแดน เท่าที่ติดตามตอนนี้ดีขึ้นโดยลำดับ ต้องให้ระดับพื้นที่สงบอยู่สักระยะหนึ่งและน่าจะกลับเข้าสู่ภาวะปกติ ปัญหาที่กระทบกระทั่งกันมีโอกาสเกิดขึ้นได้เสมอ ตอนนี้มีการทำความเข้าใจในหลายๆระดับ และคิดว่าเป็นไปในทางที่ดี ซึ่งแนวโน้มการคลี่คลายสถานการณ์ก็ดีขึ้น เพราะได้พูดคุยกันในระดับนโยบายและทำความเข้าใจในระดับพื้นที่ด้วย น่าจะเป็นไปในทางที่ดีขึ้น แต่สำหรับการตรึงกำลัง ยังคงต้องมีอยู่ แต่คงต้องระมัดระวังมากขึ้นในแง่การเคลื่อนไหว เพื่อไม่ให้เกิดเงื่อนไขนำไปสู่ความเข้าใจผิด ทำให้เกิดการปะทะกัน
สำนักข่าวเอเอฟพีรายงานว่า คณะผู้แทนเจรจาไทยและกัมพูชาได้เริ่มเปิดเจรจากันแล้วในการประชุมคณะกรรมาธิการเขตแดนร่วมไทย-กัมพูชา หรือ เจบีซี ที่มีขึ้นเป็นเวลา 2 วัน ที่กรุงพนมเปญ เมืองหลวงของกัมพูชา โดยมีเป้าหมายเพื่อแก้ไขปัญหาพิพาทตามแนวชายแดนระหว่างกัน หลังเกิดการเผชิญหน้ากันทางทหารขึ้นอีกครั้งเมื่อปลายสัปดาห์ก่อน โดยนายวา คิม ฮอง ประธานเจบีซีฝ่ายกัมพูชา กล่าวกับผู้สื่อข่าวก่อนเข้าร่วมหารือกับนายวศิน ธีรเวชญาณ ประธานเจบีซีฝ่ายไทย ว่า เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นแสดงให้เห็นว่าปัญหาตามแนวชายแดนจำเป็นจะต้องได้รับการแก้ไขโดยเร็วที่สุดเพื่อหลีกเลี่ยงการเกิดการเผชิญหน้ากันอีกในอนาคต
ส่วนสถานการณ์บริเวณอุทยานแห่งชาติเขาพระวิหาร ต.เสาธงชัย อ.กันทรลักษ์นั้นกลับคืนสู่ภาวะปกติอีกครั้ง ภายหลังพล.ต.กนก เนตระคเวสนะ ผู้บัญชาการกองกำลังสุรนารี เจรจากับพล.ท.ซรัย ดึ๊ก ผู้บัญชาการกองพลสนับสนุนที่ 3 กัมพูชา เพื่อแก้ไขปัญหาข้อขัดแย้งและยุติการยิงปะทะระหว่างทหาร2ฝ่าย อย่างไรก็ตามทหารกัมพูชายังคงใช้รถยีเอ็มซีและรถกระบะทยอยขนทหารกัมพูชาไปประจำตามฐานปฏิบัติการต่าง ๆ รอบบริเวณเขาพระวิหารซึ่งเป็นพื้นที่ที่ยังไม่ปักปันเขตแดน
การตรวจสอบพื้นที่หลังเกิดเหตุปะทะระหว่างทหารไทยกับทหารกัมพูชา พบร้านค้าของชาวกัมพูชาที่อยู่บริเวณทางด้านซ้ายทางขึ้นปราสาทพระวิหารถูกไฟเผาวอดไปกว่า 200 หลังคาเรือน เหลือเพียงเศษสังกะสีพังราบอยู่กับพื้นและยังคงมีควันไฟคุกรุ่นอยู่บางส่วน ขณะที่ฝั่งขวาทางขึ้นปราสาทพระวิหารซึ่งเป็นที่ตั้งของเจ้าหน้าที่ประจำปราสาทพระวิหารของ จ.พระวิหาร ประเทศกัมพูชา ได้รับความเสียหายเล็กน้อย เนื่องจากว่าทหารกัมพูชาอพยพชาวกัมพูชาออกไปก่อนหน้าที่จะเกิดเหตุปะทะกันหลายวันแล้ว ส่วนนักท่องเที่ยวถูกคำสั่งห้ามขึ้นไปเที่ยวชมปราสาทพระวิหาร เนื่องจากเกรงจะไม่ปลอดภัย
นายเสนีย์ จิตตเกษม ผู้ว่าราชการจังหวัดศรีสะเกษ กล่าวว่า สถานการณ์บริเวณเขาพระวิหารเข้าสู่ภาวะปกติแล้ว หลังจากทหารทั้งสองฝ่ายเจรจาแก้ไขปัญหาและสามารถตกลงกันได้ ทำให้ขณะนี้ไม่มีความรุนแรงจากการสู้รบเกิดขึ้นอีกต่อไป ส่วนกรณีกรมอุทยานแห่งชาติสัตว์ป่าและพันธุ์พืชร่วมกับกองกำลังสุรนารีสั่งปิดอุทยานแห่งชาติเขาพระวิหารชั่วคราวโดยไม่มีกำหนดตั้งแต่วันที่ 3 เมษายนนั้น หากจะเปิดเพื่อให้นักท่องเที่ยวเข้าเที่ยวชมอีกครั้ง คงต้องดูที่ความพร้อมขององค์ประกอบหลายอย่าง โดยเฉพาะความปลอดภัย และขึ้นอยู่กับการพิจารณาของทางรัฐบาลว่าจะให้เปิดอุทยานแห่งชาติเขาพระวิหารได้เช่นเดิมเมื่อใด
เขมรขนทหารตรึงรอบพระวิหาร ต้องปิดอุทยานฯยาวถึงช่วงสงกรานต์
นายก ปัดใช้เวทีอาเซียน คุย"ฮุนเซน" เชื่อสถานการณ์ดีขึ้นแล้วเมื่อคุยทวิภาคี เจบีซีไทย-เขมร เร่งแก้ปัญหาสกัดเผชิญหน้า แต่ยังคงต้องตรึงกำลังไว้ เขมรขนทหารตรึงรอบพระวิหาร กองกำลังสุรนารี-กรมอุทยาน ปิดอุทยานฯเขาพระวิหารชั่วคราวถึงช่วงสงกรานต์